SDS-PAGEとウェスタンによるタンパク質分子量測定の原理

ウェスタンブロッティングやSDS-PAGEは、タンパク質の分子量や発現量を評価するための基本的手法として広く用いられています。本技術では、タンパク質を変性させ、SDSを結合させることで一定の電荷–質量比を作り出し、電気泳動により分離します。 「見かけの分子量」と呼ばれる理由はここにあります。SDS-PAGEやSimple Westernでは、変性時にタンパク質に結合するSDS量に応じて分離されますが、結合量はタンパク質の性質や構造により変動するため、理論上の分子量と完全には一致しない場合があります。タンパク質1 gあたり約1.4 gのSDS結合を前提に一定の電荷–質量比を仮定しますが、実際には様々な要因によって移動度が影響を受けます。