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为何使用 RNAscope ISH?

疾病分析的标准分子方法依赖于分散的细胞,这会导致空间信息缺失。然而,要完整充分地了解细胞行为背后的分子机制,需要借助关于亚细胞定位的补充信息,而此类信息仅可通过原位杂交来获得。RNAscope 分析是一种新型的多重核酸 ISH 技术,拥有专利探针设计,可放大靶标特异性信号而非背景噪音,从而提供清晰、实用的结果和较高的灵敏度和特异性。

ACD RNAscope® in situ Hybridization (ISH) Technology Overview

主要 RNAscope ISH 技术应用

Advanced Cell Diagnostics 是空间基因组学和空间转录组学新兴领域的引领者,提供独特的 RNAscope 原位杂交分析,可在完整组织中可视化单个细胞中的基因表达。

RNAscope ISH 技术适用于多种应用,详细了解神经科学、癌症、免疫肿瘤学、细胞和基因疗法以及单细胞分析等重点关注领域。

开始使用 RNAscope ISH 技术

与拼图游戏类似,成功执行原位杂交技术 (ISH) 需要采用系统性、逐步式的方法,每次专注于一个过程阶段,然后进入下一个阶段。ACD 的 RNAscope ISH 技术让 ISH 在功能性和易用性方面迈出了巨大的一步,极大地简化了那些久经验证的方法,同时可常规提供单分子检测水平的灵敏度。虽然 ISH 不像四块拼图游戏那样简单,但与此前相比,我们大大提升了 ISH 的便捷性。

RNAscope ISH 技术手动分析

RNA 原位检测技术(ISH 和 FISH)已存在多年,而被视为金准则的微阵列芯片和 PCR 也是如此。然而,这些技术缺乏关于细胞和组织微环境中空间表达的临床相关信息。

Advanced Cell Diagnostics 的科学家彻底改变了 RNA ISH 方法,并在 2011 年推出了 RNAscope™ ISH,用于在完整单细胞中,从空间上对靶标 RNA 进行检测。RNAscope ISH 凭借其专有的探针设计,可同时扩大靶标特异性信号并抑制非特异性杂交引起的背景噪音,现已成为一种成熟可靠的技术,可提供手动和自动两种形式。

RNAscope

使用最广泛的 RNAscope 分析。

有显色和荧光标记两种类型。

可用作单重、双重、四重和 HiPlex 分析。

稳定、灵敏和可归档的结果。

miRNAscope

用于检测小型非编码 RNA,包括 miRNA、ASO 和 siRNA。

在空间和形态学背景下可视化基因调节。

通过单重分析和显色 Fast Red 进行检测。

BaseScope

可检测外显子连接、剪接变异体、短/高度同源的 RNA 序列和点突变。

可灵敏检测单个核苷酸差异。

提供单重(红色)或双重试剂盒。

DNAscope

检测和鉴定基因拷贝数(放大/检测)和基因重排/融合。

对小基因组区域/单个靶基因进行高分辨率和精准的靶标检测。

显色双重分析(红色/蓝色),使用明场显微镜即可观察。

RNA-蛋白共检测分析

能够同时检测细胞类型特异性基因表达和分泌的蛋白。

关联 RNA-蛋白表达并可视化细胞边缘和 RNA 靶标。

获取更多数据并节省宝贵的样本。

RNA ISH 技术自动分析

RNAscope 原位杂交技术已开发出了手动和自动方案。如果您需要高通量或自动化解决方案,ACD 已与 Leica Biosystems 和罗氏诊断合作,共同提供 RNAscope ISH 自动分析。

Leica Biosystems Inc.

在这一战略合作伙伴关系中,我们针对 Leica BOND Rx IHC ISH 平台开发了自动 RNA ISH 工作流程

罗氏诊断

我们针对罗氏 Ventana 以及 Benchmark ISH 和 IHC 染色平台,开发了自动 RNA ISH 工作流程解决方案。

RNAscope ISH 技术分析选择表

  RNAscope HD 棕色红色 RNAscope 双重 RNAscope 多重荧光 (V2) RNAscope HiPlex BaseScope BaseScope 双重 miRNAscope DNAscope
分析类型 显色 显色 荧光 荧光 显色 显色 显色 显色
提供的检测重数 单重 双重 四重 12 重;最高可达 48 重 单重 双重 单重 双重
所用染料 DAB - HRP 或 Fast Red - ALP 绿色 - HRP Fast Red - ALP TSA Plus/Opal 染料 Alexa 488、Atto 550、Atto 647N、Alexa 750 Fast Red - ALP 绿色 - HRP Fast Red - ALP Fast Red - ALP Fast Red - ALP
通道 通道 1 通道 1、2 通道 1、2、3、4 尾部 1、2、……12 通道 1 通道 1、2 通道 S1 通道 1、2
可用平台
  • 手动
  • Ventana
  • Discovery Ultra
  • Leica Bond Rx
  • 手动
  • Ventana
  • Discovery Ultra
  • Leica Bond Rx
  • 手动
  • Leica Bond Rx
  • 手动
  • 手动
  • Ventana
  • Discovery Ultra
  • Leica Bond Rx
  • 手动
  • 手动
  • Leica Bond Rx
  • 手动
靶标大小 >300 nt >300 nt >300 nt >300 nt 50-300 nt 50-300 nt 17-50 nt

>3000 nt(载体/病毒)和

>20,000 nt(染色体)核苷酸

样本类型
  • FFPE
  • 固定冰冻
  • 新鲜冰冻
  • 培养细胞
  • 整胚*
  • FFPE
  • 固定冰冻
  • 新鲜冰冻
  • 培养细胞
  • 整胚*
  • FFPE
  • 固定冰冻
  • 新鲜冰冻
  • 培养细胞
  • 整胚*
  • 固定冰冻
  • 新鲜冰冻
  • 培养细胞
  • 整胚*
  • FFPE
  • 固定冰冻
  • 新鲜冰冻
  • 培养细胞
  • 整胚*
  • FFPE
  • 固定冰冻
  • 新鲜冰冻
  • 培养细胞
  • 整胚*
  • FFPE
  • 固定冰冻
  • 新鲜冰冻
  • 培养细胞
  • FFPE
Professional Assay Services PAS

专业分析服务

专业分析服务提供符合 GCLP 的 RNAscope、BaseScope、miRNAscope 和 DNAscope 原位杂交 (ISH) 分析服务,以便为我们的学术和生物制药合作伙伴提供临床及临床前研究支持。

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